Opportunities and prospects of microbiological diagnosis of ent mycosis (review)

Abstract

The review considers one of the most important problems of modern otorhinolaryngology - the diagnosis of opportunistic mycoses. Data on the species spectrum of pathogens of oppor-tunistic mycoses of the ENT organs and their epidemiology are presented, the analysis of existing methods of laboratory diag-nosis of this pathology is given. The solution to the problem of rapid and reliable identification of fungi and determination of their sensitivity to antifungals is provided by the use of semi-automatic and automatic microbiological analyzers, as well as the use of mass spectrometry. Particular attention is paid to modern molecular genetic methods, such as polymerase chain reaction, sequencing of a new generation, which in combination with classical microbiological methods, make it possible, with the highest level of reliability, to identify microorganisms by species based on decoding their genomes. It also gives the pos-sibility to assess the sensitivity of the isolated strains to chemo-therapeutic drugs using the disco-diffusion method, the method of serial dilutions, epsilometric and the use of ATB strips. The introduction into clinical practice a set of classical and modern diagnostic technologies should become the standard for the di-agnosis of fungal diseases not only upper respiratory tract and ear, but also other biotopes of the macroorganism.

В обзоре рассматривается одна из значимых проблем со-временной оториноларингологии – диагностика оппорту-нистических микозов. Указаны данные о видовом спектре возбудителей оппортунистических микозов ЛОР-органов и их эпидемиологии, изложен анализ существующих мето-дов лабораторной диагностики данной патологии. Решение проблемы быстрой и достоверной идентификации грибов и определение их чувствительности к антимикотикам обе-спечивается применением полуавтоматических и автомати-ческих микробиологических анализаторов, а также исполь-зованием метода масс-спектрометрии.Особое внимание уделено современным молекулярно-генетическим методам, таким как полимеразная цепная реакция, секвенирование нового поколения, которые в совокупности с классически-ми микробиологическими методами, дают возможность с самым высоким уровнем достоверности идентифицировать микроорганизмы до вида на основании расшифровки их геномов. Оценка чувствительности выделенных штаммов к химиотерапевтическим препаратам происходит с помощью диско-диффузионного, эпсилометрического и метода серий-ных разведений, а также использования АТВ стрипов. Внедрение в клиническую практику комплекса классических и современных диагностических технологий должно стать стандартом диагностики грибковых заболеваний не только верхних дыхательных путей и уха, но и других биотопов макроорганизма.