Molecular and genetic characteristics of adenovirus as causes of acute diarrhea in the people of southern Ukraine

Abstract

The etiological role of adenoviruses as causative agents of acute diarrhea in the southern region of Ukraine was studied. Adenovirus DNA was detected in 10.61±1.05 % of clinical stool samples. Serotypes of two gene groups: C and F were identified during genotyping and sequencing of genetic material of detected adenovirus isolates. Gene group F (HAdV41), proves their role in the occurrence of this infectious pathology. HAdV41 isolates had a significant advantage 75.0±15.31 % and had a pronounced genetic heterogeneity, showed similarities with serotypes circulating in previous years in different regions of the world: Sweden (1978), Japan (2003, 2006), South Africa (2009–2014), Iraq (2016). The obtained results allowed to establish the geographical origin of circulating adenoviruses, as well as to predict a further increase in the intensity of the epidemic process of adenoviral infections in southern Ukraine.

Вивчали етіологічну роль аденовірусів, як збудників гострі діареї у жителів південного регіону України. ДНК аденовірусів виявлені в клінічних зразках стільця хворих у 10,61±1,05 % випадків. При генотипуванні та секвенуванні генетичного матеріалу виявлених ізолятів ідентифіковано серотипи двох геногруп: С та F. У 25,0±11,69 % хворих на гостру діарею у вигляді моноінфекції було виявлено аденовіруси геногрупи С: HAdV2 і HadV5, що поряд з серотипами геногрупи F (HAdV41), доводить їх роль у виникненні даної інфекційної патології. Ізоляти HAdV41 зустрічались із суттєвою перевагою 75,0±15,31 % та мали виражену генетичну гетерогенність, виявляючи подібність з серотипами, що циркулювали у попередні роки у різних регіонах світу: в Швеції (1978 р.), Японії (2003, 2006 рр.), Південній Африці (2009–2014 рр.), в Іраку (2016 р.). Отримані результати дозволили встановити географічне походження циркулюючих аденовірусів, прогнозувати подальше зростання інтенсивності епідемічного процесу аденовірусної інфекцій на півдні України.