Модификация метода типирования гена аполипопротеина Е человека

Abstract

Предложена модификация метода типирования гена аполипопротеина Е человека описанного Hixson J.E. и Vernier D.T. Проведенный анализ полной нуклеотидной последовательности гена аполипопротеина Е (NG 007084) и нуклеотидных последовательностей SNP rs429358 и rs7412 определил семь несовпадающих нуклеотидов в структуре олигонуклеотидного праймера F4 и четыре праймера F6. Несмотря на невозможность проведение ПЦР амплификации с использованием олигонуклеотидных праймеров описанных Hixson J.E. и Vernier D.T. метод был многократно повторен с опубликованием результатов рядом авторов. Для устранения этого несоответствия была разработана структура олигонуклеотидных праймеров которая позволила получать специфические продукты амплификации и проводить типирование гена ароЕ с использованием эндонуклеазы Hha I.

A modification of the method of typing of human apolipoprotein E gene described by Hixson JE and Vernier DT. The analysis of the complete sequence of the apolipoprotein E (NG 007 084) and the nucleotide sequences of SNP rs429358 and rs7412 identified six nucleotide mismatches in the structure of the forward primer and reverse seven. Despite the impossibility of carrying out PCR amplification using oligonucleotide primers described Hixson JE and Vernier DT method was repeated several times with the publication of the results of several authors. To resolve this discrepancy was designed structure of oligonucleotide primers which give specific amplification products and carry out genotyping using endonuclease Hha I.